苏州市港航投资发展集团有限公司（简称苏州港航集团）是苏州市人民政府国有资产监督管理委员会管理的市直属国有企业。集团建立了党委“把方向、管大局、保落实”，董事会“定战略、做决策、防风险”，经理层“谋经营、抓落实、强管理”的企业治理结构。

董事会下设战略委员会、薪酬与考核委员会、审计委员会等三个专业委员会。战略委员会负责对公司发展战略、中长期发展规划、投融资方案、兼并重组、重大资本运作、企业改革、资产经营项目等重大事项进行研究并提出建议，战略委员会下设公司投资评审小组，负责做好战略委员会决策的前期准备工作。薪酬与考核委员会负责审定公司的薪酬计划或方案，对公司董事（非外部董事）及高级管理人员进行年度绩效考评。审计委员会负责监督公司内部审计制度及其实施，与外部审计进行沟通，审查公司的财务信息及其披露，审查公司内控制度，对重大关联交易进行审计。

集团内设办公室、纪检监察室、组织人事部、发展研究中心、安全和质量管理部、生产运营中心（信息化办公室）、财务中心（计划财务部）、投资发展部、稽核审计部、合规合约部（公司律师事务部）等10个职能部门。